Dans Swagger, une fois authentifié, si on recharge la page (avec F5 par exemple), l'authentification est perdue. Il est donc nécessaire de redemander un Token JWT, de re-cliquer sur "Authorize" et de le réactiver.

Il est possible de demander à Swagger de conserver l'authentification, même en cas de rechargement de la page.
Il y a un patch qui arrive et qui permettra de le faire proprement dans Symfony : https://github.com/api-platform/core/pull/3731

En attendant, il faut modifier le fichier public/bundles/apiplatform/init-swagger-ui.js, dans la section SwaggerUIBundle, et d'ajouter
persistAuthorization: true,

Voici le bloc concerné :
const ui = SwaggerUIBundle({
        spec: data.spec,
        dom_id: '#swagger-ui',
        validatorUrl: null,
        oauth2RedirectUrl: data.oauth.redirectUrl,
        presets: [
            SwaggerUIBundle.presets.apis,
            SwaggerUIStandalonePreset,
        ],
        plugins: [
            SwaggerUIBundle.plugins.DownloadUrl,
        ],
        layout: 'StandaloneLayout',
        persistAuthorization: true,     // <---- ICI
    });