Pour que le copier/coller avec la souris fonctionne correctement avec vim, il faut que celui-ci supporte le "clipboard". Vérifier cela avec :echo has('clipboard')
Si la réponse est 0, le presse papier n'est pas disponible. Si la réponse est 1, le presse-papier sera disponible.

Si Vim ne supporte pas le presse-papier, il faut installer apt-get install vim-gtk, qui le supporte.

On peut alors mettre le

set mouse=a